公司合并注銷后，車輛指標過戶的處理辦法：

1. 需要原公司注銷，車輛過戶到新公司名下，需要時間拿到新公司的指標，才能辦理車輛過戶。
2. 車輛過戶時需要車輛違章記錄全部處理完畢，雙方公司出具的指標轉移證明材料，攜帶車主身份證原件及復印件，購車發(fā)票、車輛登記證、行車證等手續(xù)去車管所辦理。
3. 如果合并前已經將車輛轉給新公司，那么可以繼續(xù)使用合并前獲得的指標。

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